После Великой Победы в 1565 году Орден Святого Иоанна приступил к строительству нового города Валлетты. Во время пребывания в Витториозе между 1530 и 1571 годами Орден использовал приходскую церковь Святого Лаврентия, но это было лишь временным решением. Как и следовало ожидать, рыцари включили возведение монастырской церкви в свою программу строительства новой Столицы Мальты.
Главный вход в Собор Святого Иоанна. Под балконом расположены гербы ордена Святого Иоанна и Великого Магистра Жана де Касьера, и в центре расположен герб Папы Римского Григория XIII. Две мраморные надписи под ними - даты постройки и освящения храма.
Великий Магистр Жан де Валетт (1557-68) не дожил до завершения строительства города, носящего его имя, и переезд Ордена из Витториозы в Валлетту был осуществлена в период магистратуры его преемника Пьетро дель Монте (1569-72), который издал указ, но не построил Монастырскую Церковь. Возведение Собора состоялось при следующем Магистре Ордена - Жане Левеке Жане де Касьере (1572-81), при котором были построены самые важные общественные здания Валлетты. Монастырская Церковь, названная в честь покровителя ордена Святого Иоанна Крестителя, была торжественно освящена 20 февраля 1578 года.
В ноябре 1569 года, в период пребывания Ордена в Витториозе, на Собрании каноников Ордена был принят указ о возведении Монастырской Церкви Рыцарей в новом городе, оборона которого все еще находилась в стадии строительства. Было решено, что новая Церковь будет включать резиденцию для Великого Магистра - Главного Капеллана Ордена и несколько комнат для капелланов монастыря (как называли священников Ордена) и закрытое пространство для кладбища.
Фасад Собора Святого Иоана в 1930 г.
Однако строительство началось только через четыре года по инициативе Французского Великого Магистра де Касьера, о котором Бартоломео даль Поццо, историк Ордена, писал: “... в разгар шума турецкого оружия и гражданских столкновений внутри Ордена, воспламененный религиозным рвением и благочестием, он начал строительство в 1573 году”.
Действительно, де Касьер был доблестным воином, отличившимся в 1552 году при нападении на Зуару в Северной Африке, где он спас флаг Ордена от врага. Он получил звание Маршала Ордена (использовалось во Французском подразделении Ордена Овернь) и обладал высокой репутацией как на Мальте, так и за рубежом.
Проблемы с членами Ордена, который возникли позднее, могли стать причиной его низложения, но в конечном итоге он был восстановлен и оправдан Папой. По свидетельству историков, он был высокомерным и авторитарным правителем, но он, без сомнения, был искренен в своих мотивах и религиозном рвении, главным свидетельством которого является строительство Собора Святого Иоанна. При этом Великий Магистр внес необходимую сумму денежным средств на строительство Собора из личных средств.
Первый участок строительства, предназначенный для монастырской Церкви, располагался в районе, известном как Блок №27, недалеко от Святого лазарета (больницы Ордена), который в настоящее время является Средиземноморским конференц-центром. Затем стало ясно, что колокольный звон будет беспокоить пациентов больницы и предполагаемое место расположения Церкви находится не в центре Города.
Крестный ход, возглавляемый настоятелем церкви Святого Иоанна - это самое раннее известное изображение церкви Святого Иоанна. Фронтиспис к уставам Великого Магистра Гуго де Лубен Вердаль, опубликованным в 1584 гравюром Филиппом Томассинусом.
Следующий участок для строительства Собора был выбран в Блоке № 3, расположенном практически в центре нового Города на возвышенности - это место идеально подходило для самой важной церкви Ордена.
Однако участок уже был выделен бесплатно братьям Анджело и Маноли Метакси (или Мето), двум священникам Греческой православной церкви с Родоса, которые уже около двух лет работали над строительством церкви.
Великий Магистр де Касьер настоял на обмене участками, и 23 июня 1572 года перед нотариусом Пласидо Абелой был составлен и подписан акт передачи. Участок имел длину 25 ярдов вдоль Strada San Giacomo (ныне Merchants Street - Торговая улица) и 17 ярдов вдоль Strada del Monte (ныне St John's Street - улица Святого Иоанна).
Согласно надписи на главной двери Церкви, первый камень в основание был заложен 1 ноября 1573 года, но описания до настоящего времени не обнаружено. Работы, по-видимому, шли довольно быстрыми темпами, поскольку в той же надписи далее говорится, что здание было построено 22 июня 1577 года.
Гробница и памятник Великого Магистра Жана де Касьера в склепе Великих Магистров, Собор Святого Иоанна, Мальта
Церковь была построена по проекту и под руководством известного Мальтийского архитектора Джероламо (или Джеронимо) Кассара. На фасаде Церкви прослеживается испанское влияние с башнями-близнецами и деталями в стиле маньеризма. Интерьер прямоугольной формы напоминает монастырскую церковь Ордена на Родосе с округлым сводом, охватывающим неф и боковыми пределами, стены которых служат в качестве контрфорсов. Орнамент Собора был сооружен позднее. Церковь Святого Иоанна, по сути, была описана как “одна из самых странных и в то же время одна из самых впечатляющих церквей христианского мира”. Однако следует иметь в виду, что ‘клиенты’ Кассара, рыцари Святого Иоанна, имели военное прошлое, которое отражается в строгости фасада, напоминающего крепость.
С другой стороны, подразделения Ордена соперничали друг с другом, чтобы украсить свою главную церковь, что в последствии привело необычайному великолепию отделки из резного камня и картин. Главная Церковь Ордена считается самым впечатляющим зданием Кассара.
Магистр Де Касьер предвидел, что ордену, возможно, придется покинуть остров, поскольку в прошлом они были вынуждены отказаться от своих владений в Святой Земле и на о. Родос. Таким образом, в Учредительном акте монастырской церкви, подписанном 23 ноября 1577 года перед нотариусом Маттео Бриффой, Великий Магистр установил, что в случае ухода Ордена с Мальтийских островов в будущем, мальтийское духовенство должно будет освятить Собор. Этот договор остается одним из краеугольных камней среди аргументов местной Церкви, при попытке доказать право собственности Мальтийской Курии на Собор Святого Иоанна.
Слева на право: Предполагаемый потрет Джероламо Кассара, архитектора собора Святого Иоанна, Епископ Томмазо Гаргалло, который не был выбран прелатом для Собора Святого Иоанна и Портрет Великого Магистра Жана де Касьера Сципионе Пульцоне де Гаэта, расположенный в ризнице Собора Святого Иоанна, Валлетта.
Но Магистр де Касьер пошел дальше строительства Собора. 20 декабря 1578 года он выделил для нужд Церкви личное имущество, чтобы обеспечить должный уход и надлежащее освящение. Дар состоял из земель, купленных им у Джованни Паоло Гаюса (современное значение - Агия), военных трофеев, унаследованных им от настоятеля собора Дона Луки Хары, и половины имущества, переданного ему папской грамотой из владений осужденного еретика Маттео Фальзона.
Но прежде чем это дар мог быть передан, Церковь была освящена. К сожалению, де Касьер не доверил освящение Собора пламенному каталонцу Фра Томмазо Гаргалло, который еще не был посвящен в Епископы. Это решение, вероятно, и послужило причиной раздора между Великим Магистром и Епископом. Вместо этого, 17 сентября 1577 года, Магистр де Касьер получил папскую записку, в которой функция освящения Собора Святого Иоанна была делегирована Людовико де Торресу, Архиепископу Монреальскому на Сицилии.
Фасад Собора Святого Иоанна во время магистратуры великого мастера Ласкариса (1636-57), автор неизвестен.
В начале февраля 1578 года две галеры ордена Святого Иоанна находились в Сиракузах, чтобы переправить Архиепископа де Торреса на Мальту. Прелат прибыл на остров 5 февраля, а 15 дней спустя – 20 февраля – новый Храм был торжественно освящен в качестве «Основной Монастырской и Приходской Церкви Иерусалимского Ордена Святого Иоанна Крестителя». Мраморная табличка на экстерьере главного установлена на память об этом событии. Новая Церковь была подчинена Святому Престолу и пользовалась Епископскими привилегиями.